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  • 基因检测的助力之病毒篇

          新冠肺炎肆虐,牵动着所有人的神经。我们总是不禁的回忆起2003年爆发的非典,但随着对病毒研究的不断深入,对基因测序技术的飞速发展,面对一无所知的新冠肺炎,也不会不知所措,相反,在第一时间就搞清楚了新型冠状病毒肺炎病毒的种类和结构,甚至搞清楚了病毒的基因序列和发病机制。因此,一大批根据此基因序列开发的诊断试剂盒也如春笋般涌现,为目前新冠肺炎的确诊提供了有力的判读依据,也为疫苗的研发奠定了基础。毫无疑问,当一种全新未知的新型病毒出现,我们很大程度上都会依赖于基因层面的研究,并通过基因深入解决诸多问题。主要分为:

    1. 确认引起传染病的病原微生物

    2. 病原体的诊断

    3. 治疗该病原微生物的药物和疫苗


    1、基因检测助力病毒的快速确认

          此次新型冠状病毒的快速确认很大程度上依赖于基因检测技术。有了新型冠状病毒的全基因组序列,意味着拿到病毒的完整大数据,病毒的生长、传播是否存在变异也都可以进行动态追踪,一目了然。


    2、基因检测对于病原体的诊断至关重要

          基因检测也被指定为新型冠状病毒的诊断手段之一。纵观目前经国家药监局批准的7家新型冠状病毒核酸检测试剂盒,绝大部分采用RT-PCR法进行诊断。因RT-PCR法的检测速度快,准确度高,以每台仪器2小时内就能精准检测96份样本的极大便利性得以在临床广泛应用。并且在新冠肺炎诊疗方案第五版中指出,以样本在RT-PCR新型冠状病毒核酸检测中呈阳性、或经基因测序后与已知的新型冠状病毒高度同源作为病原体的确诊证据。因此,基因检测不仅为病毒的进化来源、致病机理提供了一手资料,同时也为开发特异性诊断试剂盒提供了重要的依据。

    但是,值得注意的是,新冠肺炎核酸检测假阴性的问题最近层出不穷,核酸检测试剂盒核酸检出率低,甚至需要多次反复检测才能确诊。这就说明,很大可能有些厂家在产品开发初期优化不足,导致灵敏度不够,检测结果不稳定。

    面对这样的情况,伟禾也做了一些应对措施。开发一种可靠稳定、全程监控的新型冠状病毒核酸检测的质控品,MS2噬菌体病毒样颗粒。MS2噬菌体的蛋白外壳可以保护其内RNA免于RNaseA和DNase I的作用而在较长时间内保持理化性质的稳定,因此,可将新型冠状病毒基因通过基因工程技术包裹到这些病毒外壳内以避免核酸酶的降解作用。以该方法制备的新型冠状病毒质控品可以模拟病毒颗粒核酸检测中样本处理、核酸提取和核酸检测的全部过程。同时可对病毒载量进行定量分析,对各厂家试剂盒、各实验室的检测能力进行评估,促进实验室提高新型冠状病毒核酸检测能力。群策助力,八方献策,面对此次屡见不鲜的假阴性判断也将会有越来越多的补救方法,共同应对此次的应急疫情。


    3、药物疫苗的开发

          在医护人员在一线与新冠肺炎抵抗斗争的同时,多个国家也都在分离新型冠状病毒毒株,开始了疫苗的研发,甚至可以说疫苗是全村的希望了。在减毒活疫苗和DNA疫苗研发中也会需要用基因检测进行相应的验证。

    以上仅以本次2019-nCoV为例阐述基因检测无论在确认病原体的类型、诊断和疫苗开发都有着重要作用。不仅是病毒,传染病,备受关注的癌症也都离不开基因。近年来,全基因组技术以快速,高通量,精度高的特点得以快速发展,但成本高也是制约其发展的主要因素。因此,靶向测序技术成为人们研究目标基因的重要手段。靶向基因检测多集中于上述提到的RT-PCR法,多重PCR技术速度快,起始量少,成本低的特点越来越受到行业的关注。无论是此次病毒的全基因组测序,还是靶向测序,在免疫治疗的时代中基因都会是不可或缺的技术佐证。精细指导每位患者治疗的同时,也会需要更加全面的信息。促进宏观基因组检测和靶向基因检测互补才能使得人类对于疾病全面了解,并且高效筛选出特异性的靶向位点。一代或二代测序和RT-PCR法的有效结合,也会成为探究基因组方法学的黄金组合。


          伟禾拥有丰富的核酸检测试剂盒研发经验,拥有完善的多重荧光PCR实验体系。同时,对一代测序也了然于心。面对此次疫情,开发相应的核酸检测试剂盒对伟禾来说相对容易,之所以未在第一时间蹭热度,是因为我们深知一个严谨的研发需要一套完整的质控。毕竟市场需要的并非核酸试剂盒的产量,而是质量。仓促上线缺乏临床验证,质量不稳定等一系列情况反而会让一些病例放松警惕,扩大社会影响。因此,正如此次我们重点关注的MS2的构建可有效提高试剂盒的准确性,减少实验结果的假阴性和假阳性,伟禾更愿意遵从实际情况出发,不违背科学规律,沉淀下来开发符合质量标准的体系,静待花开。



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